標的イオンを不活性ガスに衝突させ，結合を開裂させる断片化法．衝突速度の比較的遅いCID（collision-induced dissociation）法と，衝突速度を高めたビーム型CID（higher-energy CID：HCDともよばれる）がある．ペプチド結合の場合，αアミノ基とαカルボニル基の間で開裂され，bイオンとyイオンが生じる．（実験医学2026年4月号より）
N-グライコプロテオミクス―糖タンパク質の種類・糖鎖修飾部位・部位ごとの糖鎖の網羅的解析法実験医学2026年4月号エネルギーを加えた分子イオンをタンデムMS装置内の衝突室へ通過させ，衝突室に充満した不活性ガス（窒素やアルゴン）と衝突させることで分子構造を解離する代表的なフラグメンテーション法．リピドミクスのみならずメタボロミクス（代謝物解析）やプロテオミクス（タンパク質解析）でも広く用いられる．（実験医学増刊4115より）
マルチオミクス データ駆動時代の疾患研究
がん、老化、生活習慣病 最新のオミクス統合で挑む標的探索と病態解明
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