実験医学増刊 Vol.27 No.12

疾患遺伝子の探索と超高速シークエンス

パーソナルゲノム時代の疾患解明と治療戦略

  • 辻 省次/編
  • 2009年07月21日発行
  • B5判
  • 216ページ
  • ISBN 978-4-7581-0300-8
  • 定価:5,400円+税
  • 在庫:なし
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次世代シークエンサーの台頭とともに,癌・認知症・糖尿病などの多因子疾患が遺伝的要因から解明されています.最新研究成果のレビュー,大規模データを扱う解析手法の紹介まで,来たる個人ゲノム時代に必携の一冊!

目次

第1章 ゲノム医学と医療応用の最前線

1. オーダーメイド医療実現化プロジェクト【田中敏博】

  • 1. サンプルおよび臨床情報収集システムの構築
  • 2. サンプル保管システムの構築
  • 3. サンプル配布システムの構築
  • 4. ELSI委員会(旧ELSIワーキンググループ)の設立
  • 5. 現在までの成果と今後

2. 糖尿病関連遺伝子研究の現状と展望【春日雅人】

  • 1. 増加する糖尿病
  • 2. 糖尿病の遺伝素因
  • 3. GWASによる糖尿病の遺伝素因の探索

3. アルツハイマー病の遺伝素因【桑野良三/宮下哲典】

  • 1. 疫学
  • 2. 原因遺伝子
  • 3. リスク遺伝子
  • 4. Imaging Genetics

4. 孤発性パーキンソン病の分子遺伝学【三井 純/戸田達史】

  • 1. 多型(common variant)を用いた疾患感受性遺伝子研究の概略
  • 2. PDと関連するmultiple rare variantの例

5. 脳梗塞の遺伝要因【久保充明】

  • 1. 脳梗塞における遺伝的要因
  • 2. 候補遺伝子解析による脳梗塞関連遺伝子
  • 3. マイクロサテライトを用いた連鎖解析による脳梗塞関連遺伝子
  • 4. SNPに基づくゲノムワイド関連解析

6. ゲノム解析による脳動脈瘤感受性遺伝子同定【秋山康一/井ノ上 逸朗】

  • 1. 家族性脳動脈瘤の遺伝的背景
  • 2. 孤発性脳動脈瘤の遺伝要因
  • 3. 脳動脈瘤感受性遺伝子

7. 神経芽腫のゲノム解析によるALK遺伝子変異の同定【小川誠司】

  • 1. 神経芽腫におけるALK遺伝子変異の発見
  • 2. 変異ALKキナーゼの発癌活性
  • 3. 神経芽腫治療とALK阻害剤

8. 大きく変革しつつある癌ゲノム研究と国際癌ゲノム共同研究【柴田龍弘】

  • 1. 新しい癌ゲノム解析研究の形
  • 2. 国際協調型の癌ゲノム研究
  • 3. バイオリソースバンク整備・情報解析技術の重要性

9. 関節疾患【池川志郎】

  • 1. ゲノムから疾患遺伝子へのアプローチ
  • 2. OA(変形性関節症)
  • 3. OAの疾患感受性遺伝子の診断への応用
  • 4. 疾患感受性多型による分子病態の解明

10. 乾癬のマイクロサテライトによるゲノムワイド関連解析【岡 晃/猪子英俊】

  • 1. 疫学および遺伝性
  • 2. HLA(human leukocyto antigen)
  • 3. 遺伝子座異質性
  • 4. ゲノムワイドなマイクロサテライト
  • 5. 乾癬のゲノムワイドな関連解析

11. ファーマコゲノミクスと医療応用【莚田泰誠】

  • 1. ファーマコゲノミクスの実用例
  • 2. ファーマコゲノミクスの新しい展開
  • 3. ファーマコゲノミクスに基づくオーダーメイド投薬の展望

12. コピー数多型(CNV)と疾患解析【石川俊平/梅田高呂】

  • 1. CNVと疾患
  • 2. common diseaseにおけるrare CNV/de novo CNV
  • 3. CNVの発生と性質
  • 4. CNVの解析技術
  • 5. 並列型シークエンサーを用いたゲノムコピー数解析
  • 6. コピー数異常の臨床検査への応用とコピー数のデジタルカウント

第2章 全ゲノム解析によるゲノム医科学の展望

1. ヒトゲノムの多様性:ゲノムワイド多型研究のインパクト【徳永勝士】

  • 1. 疾患遺伝子同定の加速化と集団差
  • 2. 通常形質にかかわる遺伝子の同定
  • 3. 人類集団の近縁性と個人の遺伝的背景

2. 次世代シークエンサーによる医科学研究のパラダイムシフト【菅野純夫】

  • 1. 疾患感受性遺伝子の探査
  • 2. 体細胞変異解析
  • 3. 統合トランスクリプトーム
  • 4. ヒトマイクロバイオーム

3. 次世代シークエンサーによるゲノム解読と今後の動向【豊田 敦/藤山 秋佐夫】

  • 1. 次世代シークエンス技術の特徴
  • 2. テラシークエンス時代の到来
  • 3. 次世代シークエンサーを用いた今後のゲノム解析

4. メタゲノミクスとヒト腸内細菌叢の機能【服部正平】

  • 1. メタゲノム解析
  • 2. 健康なヒト腸内細菌叢のメタゲノム解析
  • 3. 疾患関連の腸内細菌叢のメタゲノム解析
  • 4. 国際ヒトマイクロバイオーム計画と将来展望

5. microRNAシークエンス解析【間野博行】

  • 1. 大量シークエンスによるmiRNAの発現プロファイル
  • 2. 癌とmiRNA

6. マイクロアレイと次世代シークエンサーによるDNAのメチル化解析【三浦史仁/伊藤隆司】

  • 1. DNAのメチル化状態の検出
  • 2. マイクロアレイによるメチル化解析
  • 3. 次世代シークエンサーとメチル化解析

7. 次世代シークエンサーの研究基盤—日本と世界の状況【林良英】

  • 1. 次世代シークエンサーがライフサイエンス研究に与えるインパクト
  • 2. シークエンサーの用途の多様化
  • 3. 研究基盤としての次世代シークエンサー

第3章 遺伝統計学とインフォマティクス,データの管理

1. パーソナルゲノム時代の遺伝統計学【角田達彦】

  • 1. 多因子疾患のモデルとゲノムワイド関連解析
  • 2. サンプル数とサンプル間の関係の問題
  • 3. 関連ローカスを中心とした解析
  • 4. パーソナルゲノム時代の解析:個人の多様性へ
  • 5. オーダーメイド医療を推進する遺伝統計学

2. 遺伝子疾患関連研究で必要とされるサンプルサイズ【大橋 順】

  • 1. ケースコントロール関連解析の方法
  • 2. 浸透率と対立遺伝子頻度の推定
  • 3. 検出力とサンプルサイズ

3. 複数SNPの相互作用とハプロタイプを考慮したゲノムワイド関連解析【中道 礼一郎/角田達彦】

  • 1. 遺伝子間相互作用を考慮した複数SNPの関連解析
  • 2. ハプロタイプ解析

4. 構造多型,特にコピー数多型とその解析法【加藤 護/角田達彦】

  • 1. コピー数多型の性質
  • 2. コピー数多型の検出とその分析法
  • 3. コピー数多型の関連解析
  • 4. 逆位
  • 5. その他の構造多型

5. 次世代シークエンサーを用いたゲノムインフォマティクス【森下真一】

  • 1. 次世代シークエンサーの応用と情報処理
  • 2. ソフトウェア

6. 研究リソースおよびゲノムデータの共有と管理

Ⅰ 公的バンクの定義とあり方【増井 徹】
  • 1. 公的バンクの定義
  • 2. 公的バンクのあり方
Ⅱ ゲノムワイド関連解析データの公開と共有【小池麻子/徳永勝士】
  • 1. 海外のGWAS database
  • 2. 統合データベースプロジェクトでのGWAS database
Ⅲ 統合データベースプロジェクト【川本祥子】
  • 1. 増え続ける生命科学データベース
  • 2. 科学データと一体化するデータベース
  • 3. 統合データベースプロジェクトのサービス
  • 4. 次の統合ステップに向けて
Ⅳ パーソナルゲノムデータの保護と利用のための情報セキュリティ【箕輪真理】
  • 1. ゲノムの情報セキュリティとは
  • 2. ゲノム情報の公開・セキュリティに関する検討状況と具体的なルール作り

第4章 パーソナルゲノム時代と社会

1. パーソナルゲノム時代の倫理的・法的・社会的問題【位田隆一】

  • 1. 問題の所在
  • 2. 研究の進展と倫理問題の重心移動—ゲノムシークエンス時代からパーソナルゲノム時代へ
  • 3. パーソナルゲノム時代の倫理基準
  • 4. 倫理ガバナンス(BBDBの管理・運営)

2. パーソナルゲノム時代の研究倫理─国際動向と日本の課題【加藤和人】

  • 1. 孝慮すべきポイントは何か?
  • 2. プライバシーの保護・データの公開
  • 3. 国際研究プロジェクトにおける対応
  • 4. 日本の課題

3. 社会の中のゲノム医学研究【武藤香織/山縣 然太朗】

  • 1. これまでの研究活動
  • 2. 意識調査の結果から

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  • 【本書名】実験医学増刊:疾患遺伝子の探索と超高速シークエンス〜パーソナルゲノム時代の疾患解明と治療戦略
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