実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:シングルセル解析プロトコール〜わかる!使える! 1細胞特有の実験のコツから最新の応用まで
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実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ

シングルセル解析プロトコール

わかる!使える! 1細胞特有の実験のコツから最新の応用まで

  • 菅野純夫/編
  • 定価 8,000円+税
  • 2017年09月発行
  • B5判
  • 345ページ
  • ISBN 978-4-7581-2234-4
  • 販売状況: 注文可能
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1細胞ごとの遺伝子発現をみる「シングルセル解析」があなたのラボでもできる!1細胞の調製法や微量サンプルのハンドリングなど実験のコツから,最新の応用例までを凝縮した1冊.

内容見本
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目次

レビュー編 シングルセル解析の重要性

1 シングルセル解析とは何か? なぜ今なのか?【菅野純夫】
2 がん研究とシングルセル解析【油谷浩幸】
3 免疫研究とシングルセル解析 1細胞粒度の細胞社会学【小原 收】
4 幹細胞・発生研究とシングルセル解析【渡辺 亮】
5 シングルセル解析による神経科学の新展開【Adrian W. Moore,谷口浩章,上口裕之】
6 環境微生物研究に革命をもたらしたシングルセル解析【本郷裕一】

プロトコール編 シングルセル解析の実際

オーバービュー

1 シングルセル解析のための一細胞調製法【伊藤隆司】
2 シングルセル解析における前処理の意義【永澤 慧,鹿島幸恵,関 真秀,鈴木 穣】
3 1細胞RNA-Seqデータ解析【露﨑弘毅,二階堂 愛】
4 ゆらぎ・ばらつきの諸問題(生物/測定由来)【大野雅恵,谷口雄一】

1細胞分取の実際

5 血球系細胞シングルセル解析のための細胞分取【黒滝大翼,田村智彦】
6 オルガノイドからの1細胞分取

ヒトiPS細胞を用いた肺の分化研究への応用【山本佑樹,後藤慎平】

7 組織からの1細胞分取【橋本真一,上羽悟史】

ゲノム解析

8 シングルセルゲノム解析に向けた全ゲノム増幅法【根岸 諒,吉野知子】
9 C1システムを用いたシングルセル全エキソームシークエンス【関 真秀,Sarun Sereewattanawoot,鈴木 穣】

RNA(トランスクリプトーム)解析

10 C1システムを用いたシングルセルRNA-Seq【関 真秀,鈴木 穣】
11 Chromiumシステムv2によるシングルセルRNA-seq【鹿島幸恵,関 真秀,鈴木 穣】
12 Nx1-seq

マイクロウェルプレートを用いた1細胞遺伝子発現解析【橋本真一】

13 C1 CAGE法一細胞が有するRNAの5′末端を捉える【河野 掌,加藤紗智,Jay W. Shin,Piero Carninci】
14 ICELL8によるシングルセルRNA-Seq【日下智聖,瀬尾淳哉,松崎耕二,北川正成】

エピゲノム解析

15 シングルセルメチローム解析(PBAT法)【三浦史仁,伊藤隆司】
16 シングルセルオープンクロマチン解析【鈴木絢子,鹿島幸恵,関 真秀,鈴木 穣】
17 シングルセルHi-C法によるクロマチン高次構造解析【永野 隆】
18 シングルセルクロマチン免疫沈降法(scChIP-seq)【藤木克則,白髭克彦】

その他のシングルセル解析

19 微生物のシングルセルゲノム解析【細川正人,丸山 徹,西川洋平,竹山春子】
20 シングルセルTCRレパトア解析【松谷隆治,鈴木隆二】
21 マスサイトメトリーによるシングルセル解析の実際と可能性【竹内美子,西川博嘉】
22 組織透明化と三次元イメージングによるセルオミクスの実践【洲﨑悦生】

発展編 高度なシングルセル解析・データ解析

1 多階層シングルセルオミクス解析【吉田大和,谷口雄一】
2 シングルセルにおけるncRNA解析【Chung-Chau Hon,伊藤恵美,吉原正仁,Piero Carninci】
3 細胞の分化系譜:CellTree【津田宏治,David A. duVerle】
4 Hi-Cという染色体の立体パズルを解く【小田有沙,平田祥人,太田邦史,合原一幸】
5 分化過程の再構築と擬時間に基づく発現変動解析【松本拡高,木立尚孝,二階堂 愛】
6 シングルセルシークエンスデータを読み解くための情報解析【岩本一成,岡田眞里子】
7 シングルセルからの核・細胞質の取得【池内真志,谷内江 望,関 元昭】

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