実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:フロントランナー直伝 相分離解析プロトコール〜今すぐ実験したくなる、論文にはないコツや技
実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ

フロントランナー直伝 相分離解析プロトコール

今すぐ実験したくなる、論文にはないコツや技

  • 加藤昌人,白木賢太郎,中川真一/編
  • 2022年07月05日発行
  • B5判
  • 247ページ
  • 付録:スクリプト
  • ISBN 978-4-7581-2259-7
  • 定価:7,920円(本体7,200円+税)
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細胞内相分離を引き起こす主要な因子として,タンパク質のlow-complexity(LC)配列/ドメイン(LCD)が知られている.構造をもたない天然変性領域として認識されてきたLCDは,分解されやすく,凝集・沈殿しやすい“厄介者”として生化学者や構造生物学者から忌み嫌われてきた.しかし,これまでの研究で,じつは凝集(自己相互作用)しやすい性質それ自体が,LC配列の細胞内での本来の機能であることがわかってきた.例えば,LCDの相分離・相転移現象は,その機能を利用した代表例であり,RNA顆粒などの細胞内非膜性構造体の形成原理と考えられている.…

加藤昌人(テキサス大学サウスウエスタンメディカルセンター生化学科/量子科学技術研究開発機構量子生命科学研究所)

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「これって相分離?」と悩むあなたに.精製やイメージング,動態評価,定量解析など,実績ある先駆者たちによる細胞内外での解析プロトコールを結集.さらに頻発トラブルへの対応もQ&A形式で多数掲載!

目次

序【加藤昌人】

レビュー編

Ⅰ.概論

1 群れることの意味─非膜オルガネラの生理機能【春田奈美,中川真一】

Ⅱ.基礎知識

2 アミノ酸溶液とタンパク質溶液の基本的な性質【白木賢太郎】
3 Low-complexity配列による相分離・相転移機構【加藤昌人】
4 細胞内相分離におけるRNAの役割【山崎智弘,廣瀬哲郎】

プロトコール編

Ⅰ.in vitro(細胞外)

1 精製Atgタンパク質を用いたin vitro液滴形成と蛍光観察【藤岡優子】
2 精製FUSによる相分離の顕微鏡観察と温度依存性解析【吉澤拓也】
3 DNA/タンパク質相分離の再現実験【冨田峻介,三村真大】
4 人工細胞中での相分離観察【柳澤実穂,本田 玄,渡邊千穂】
5 リコンビナントlow-complexityドメインの精製法【加藤昌人】
6 ハイドロゲル結合実験によるlow-complexity配列の線維形成能の評価【加藤昌人】
7 Low-complexity配列に特異的に作用する低分子化合物 〜biotinylated isoxazoleと1,6-hexanediol【加藤昌人】
8 ラマン顕微鏡による相分離の定量解析【梶本真司,柴田大輝,中林孝和】

Ⅱ.in vivo(細胞内)

9 細胞内液滴の形成観察とFRAPによる動態観察【安田さや香,遠藤彬則,佐伯 泰】
10 低酸素条件下で形成する代謝酵素集合体の観察【三浦夏子】
11 タンパク質クラウディング状態の蛍光プローブによる測定【吉村成弘】
12 SNAP-tagを用いた一分子イメージング法【伊藤由馬,斉藤典子】
13 近位ビオチン標識法【栗原美寿々】
14 観察した液滴の画像解析による定量評価【渡邊謙吾】
15 過剰発現が引き起こす相分離構造と細胞毒性の評価【難波匠太郎,守屋央朗】
16 オプトジェネティクスによる相転移の操作【浅川和秀,半田 宏,川上浩一】

Ⅲ.in silico

17 液滴研究に関連したデータベースと解析プログラム【安保勲人,小澤侑平,太田元規,福地佐斗志】

発展編

1 CARS顕微鏡 〜Lipid dropletsからLiquid dropletsの可視化へ【加納英明】
2 新たな液中走査電子顕微鏡の開発と生物試料の直接観察【小椋俊彦】
3 中性子散乱【中川 洋,松尾龍人】
4 放射光円偏光二色性分光法による液 ‐ 液相分離の観測【藤井健太郎】
5 分子シミュレーションで理解する相分離のメカニズム【Cheng Tan,新津 藍,依田隆夫,杉田有治】

索引

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  • 【本書名】実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:フロントランナー直伝 相分離解析プロトコール〜今すぐ実験したくなる、論文にはないコツや技
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