クロマチンが密に凝集しており,転写抑制された染色体領域.半永久的に遺伝子発現がみられない構成的ヘテロクロマチン(セントロメアなど)と,条件によっては遺伝子の発現がみられる条件的ヘテロクロマチン(哺乳類雌のX染色体など)がある.