ユビキチン化タンパク質は,このドメインをもつ分子によって認識され,シグナルが伝えられる.構造上,複数のファミリーが存在し,UBD(ubiquitin binding domain),UIM(ubiquitin interacting motif),MIU(motif interacting with ubiquitin)などと略される.