主成分分析

主成分分析は，数万次元におよぶ遺伝子発現空間内のサンプルの分布を可視化する1つの方法である．二次元平面で可視化を行う場合，サンプルの分散が最大となる方向を第一主成分．それに直交する二番目に分散が大きい方向を第二主成分として決定し，サンプル点をプロットする．主成分分析は線形変換であり，サンプル点同士の近さ関係が保たれるため使い勝手がよい．

参考書籍

• 実験医学 2015年1月号 Vol.33 No.1 特集「シングルセル生物学」