腸内細菌叢を構成する細菌種や細菌数が減少することにより,細菌叢の多様性が低下した状態を示す.dysbiosisは主に抗生物質の投与や偏った食事,病原体感染といった外因性(後天性)と,遺伝的な素因による免疫異常などの内因性(先天性)の原因によって引き起こされると考えられている.