がん細胞表面のMHCによって提示されるペプチドの多くは自己である.一方,がん細胞にはDNA変異が生じている場合が多く,その部位から翻訳されアミノ酸配列に変異が生じたペプチドがMHCに提示された場合,T細胞はこれに強く反応する.この変異ペプチドはネオアンチゲンと称される非自己の抗原である.