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これまでの章でLinuxコマンドの基本的な操作を学んできました.ここでは,実際の生命科学研究で遭遇するような,より実践的なデータ解析を体験していきます. 研究の現場では,公共データベースから大規模なデータをダウンロードし,そのデータが壊れていないかを確認し,目的に応じて加工・集計するという一連の作業が日常的に行われます.本章では,wgetやcurlといったコマンドでWeb上のデータを手元にもってくる方法から始め,gzipによるファイルの圧縮・解凍,そしてcut,sort,uniqといった強力なコマンドをパイプでつなぎ合わせ,膨大なテキストデータから意味のある情報を抽出するテクニックまでを学びます.… 続きを読む
これまでの章でLinuxコマンドの基本的な操作を学んできました.ここでは,実際の生命科学研究で遭遇するような,より実践的なデータ解析を体験していきます. 研究の現場では,公共データベースから大規模なデータをダウンロードし,そのデータが壊れていないかを確認し,目的に応じて加工・集計するという一連の作業が日常的に行われます.本章では,wgetやcurlといったコマンドでWeb上のデータを手元にもってくる方法から始め,gzipによるファイルの圧縮・解凍,そしてcut,sort,uniqといった強力なコマンドをパイプでつなぎ合わせ,膨大なテキストデータから意味のある情報を抽出するテクニックまでを学びます.…
生命科学データ解析に必須な知識や普遍的な問題解決力を身につけられる入門書!データ解析の場面で広く使われるLinuxをベースに,実際の生命科学データを用いて手を動かしながら解析手法を学べます.これからデータ解析を始めたい方に向けて丁寧に解説しており,プログラミングが苦手な方にもおすすめです.
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