トピックス

Illumina帝国への挑戦者たち

東京農工大学大学院工学府生命工学専攻　養王田正文

実験医学2023年4月号

Nature Method誌は2022年のMethod of the Yearにlong-read sequencingを選出した^1）．周知のように，Pacific Biosciences社のSMRT（Single Molecule Real-Time）sequencingでは20 kb以上の長鎖を99.9％精度で解析し，Oxford Nanopore Technologies社のnanopore sequencingでは，100 kb程度を99％精度で解析できる．この長鎖解析技術により，ギャップのないヒトゲノムの完全長解析が実現した^2）．しかし，long-read sequencing技術は，まだエラーが多いという問題があり，short-read sequencingによる解析とのHybridで解析が行われている．short-read sequencingの市場をほぼ独占してきたのが，Illumina社である．Illumina社は，群雄割拠したNGS戦国時代を勝ち抜き統一した勝者であり，1000ドルゲノムを実現し，現在のゲノム解析のコストは600ドルまで下がっている．Illumina社によるゲノム解析の支配に抵抗してきたのがlong-read sequencingの2社であるが，short-read sequencingでも挑戦者が現れて来ている^3）．

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DOI：10.18958/7223-00004-0000411-00