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ナノポアシークエンサーを用いたRNA修飾の網羅的直接解読

Comprehensive identification of RNA modifications via nanopore direct RNA sequencing
上田宏生
Hiroki Ueda：東京大学先端科学技術研究センター先端データサイエンス分野
10.18958/7757-00001-0006057-00

従来のRNA修飾解析は，質量分析法や抗体・化学反応を用いたNGS法に依存していたが，それぞれ特異性や網羅性の問題を抱えていた．近年，ナノポアシークエンシングによりRNA分子を直接読み取ることで，複数種類の修飾を同時に検出できる可能性が広がっている．本稿では，これまでの手法と比較しながら，ナノポア技術によるRNA修飾解析の現状と課題，そしてわれわれの取り組みを紹介する．

エピトランスクリプトーム，ロングリードシークエンサー，深層学習

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