実験デザインからわかる　マルチオミクス研究実践テキスト

序

執筆者一覧

本書の使い方

第1章 マルチオミクス研究を始める前に

1. 本書の概要と，実験を始める前に考えること【大澤　毅】

2. マルチオミクス研究における解析戦略と環境整備【島村徹平】

第2章 各オミクスによるデータ取得

1. ゲノム・エピゲノムのデータ取得【永江玄太】

2. トランスクリプトームのデータ取得【金井昭教，鈴木絢子，鈴木　穣】

3. 1細胞CRISPR解析によるデータ取得【加藤真一郎】

4. Ribo-Seqのデータ取得【山下　映，岩崎信太郎】

5. プロテオミクスのデータ取得【松本雅記】

6. 1細胞グライコームのデータ取得【舘野浩章】

7. メタボロームのデータ取得【曽我朋義】

8. ノンターゲットリピドミクスのデータ取得【内野春希，有田　誠】

第3章 各オミクスにおけるデータ解析

1. ゲノム解析【中村　航，坂本祥駿，白石友一】

2. CustardPyを用いたゲノム立体構造解析【長岡勇也，中戸隆一郎】

3. scRNA-Seq解析【萩原　柾，大倉永也】

4. scATAC-Seqによる転写制御解析【河口理紗，堀江健太】

5. マルチオミクス1細胞動態推定【島村徹平，野村怜史】

6. 空間トランスクリプトーム解析【鈴木絢子，金井昭教，鈴木　穣】

7. 1細胞摂動解析【島村徹平，廣瀬遥香】

8. メタボロームデータ解析と実験デザイン【松田史生】

9. メタゲノム解析【森　宙史】

10. マルチオミクスデータの解析【阿部　興，島村徹平】

第4章 各研究におけるマルチオミクス実験・解析の実例

1. 2型糖尿病に伴う糖代謝変化と制御のマルチオミクス解析【大野　聡，黒田真也】

2. 循環器疾患のマルチオミクス解析【野村征太郎】

3. 脂肪細胞分化におけるマルチオミクス解析【松村欣宏，伊藤　亮，米代武司，稲垣　毅，酒井寿郎】

4. 腫瘍微小環境におけるマルチオミクス解析【大澤　毅】

5. 長寿研究におけるマルチオミクス解析【佐々木貴史，新井康通】

6. 脳とマルチオミクス解析【酒井誠一郎，津山　淳，七田　崇】

索引