知識ゼロから始める　AIによる動物行動解析

序【村田幸久】

基礎編

基本知識

1 実験動物を用いた撮影に必要な法令・指針の基礎知識　〜動物行動動画解析を行う前に知っておくべきこと【村田幸久，坂本直観，宮﨑優介，小林幸司】

2 人工知能の基礎知識　〜人工知能，機械学習，ニューラルネットワーク【小林幸司】

3 公開されている動物行動解析用ソフトウェアを知る【坂本直観，掛野仁志，村田幸久】

4 既存動物行動解析手法の系譜とその限界，そしてAIへの期待【宮川和也，黒川和宏，髙橋浩平，持田（齋藤）淳美，武田弘志，辻 稔】

主要ソフトウェアの使い方

5 DeepLabCutの使い方【杉永友美，渡辺英治】

6 はじめてのMATLABコーディング：YOLOを動かす【松尾隆嗣，大西啓太】

7 OpenCVを使った画像処理【小林幸司，坂本直観，宮﨑優介，村田幸久】

実践編

齧歯類の行動解析

1 DeepLabCutを用いたラットの歩行分析【出澤真乃介，高島一郎】

2 DeepLabCutとSimple Behavioral Analysisを用いたマウスの社会性評価【大橋信彦，田渕克彦】

3 ラットの発声と行動のオープンソース環境による統合解析【岡ノ谷一夫，鎌谷美希，博多屋汐美，齋藤優実，外谷弦太】

霊長類の行動解析

4 FulMAIを用いたマーモセットの行動解析【圦本晃海，佐々木えりか】

5 マーモセットの頭部固定下での行動と神経活動の同時計測システム構築【蝦名鉄平】

6 AIによるサル複数個体の姿勢推定【松本惇平，兼子峰明，井上謙一】

魚類や虫の行動解析

7 YOLOを使った水槽内の魚類の検出—トラフグを例に【八杉公基】

8 AI技術を活用した昆虫の行動解析・介入ツール【山ノ内勇斗，田中良弥，上川内あづさ】

9 姿勢推定アルゴリズムによる線虫の行動解析【豊島 有】

番外編

1 マウスホームケージモニタリング　〜長期・自動的なデータ取得とその運用【古瀬民生】

発展編

プログラミングによる高精度な行動解析

1 動画解析を用いた実験動物の自発運動の評価法【宮﨑優介，小林幸司，村田幸久】

2 深層学習を利用したマウスのひっかき行動，グルーミング行動の解析【坂本直観，小林幸司，村田幸久】

3 深層学習を用いた複数匹のマウスを追跡する技術【坂本直観，村田幸久】

4 深層学習モデルを用いた高精度なマウスの行動分類【竹村 裕】

5 機械学習と情報理論によるゼブラフィッシュの行動解析【河野 輝，政井一郎，Greg J. Stephens】

6 ゼブラフィッシュ実験のAI品質管理システム【田中利男】

汎用化された解析システム・委託解析

7 マウスのAI行動解析システムSHIGUSAを用いた解析【村田幸久，小林 唯，福田将大，大崎真里亜，余田修助，木田美聖，大森啓介】

8 共同研究・外注解析のコツ　〜創薬のDXに向けた正しい解析のために【村田幸久】

索引