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ついに細菌のシングルセルRNA-seqが可能に！？ ―細菌の集団中から生まれる個性に迫る

筑波大学医学医療系トランスボーダー医学研究センター　尾花　望

実験医学2021年4月号

細菌は単細胞であるが，たとえモノクローナルな集団であったとしても，個々の細胞の遺伝子発現は非常に不均一である．細菌はランダムに亜集団に分化することが可能であり，これはさまざまな環境中で生存するためのベッドヘッジング（両賭け）戦略となっている．例えば，パーシスタンス（抗生物質耐性）やコンピテンシー（自然形質転換能）は，抗生物質による細菌感染症治療において大きな課題となっており，確率的に細菌集団中の一部の細胞において発現する．これらのレアな細胞分化の現象を解明するためには，バルクのトランスクリプトーム解析といった集団の“平均”を算出する方法では不十分である．現在までに，このような細菌の“個性”の解析には，蛍光顕微鏡やフローサイトメトリー法といった手法が主に用いられてきたが，これらでは限られた遺伝子セットのみの解析に留まる．

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