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SDL-TOPO法の活用による短鎖1本鎖DNAの検出血中セルフリーDNAの分析を例に

Single-stranded DNA analysis opens a new horizon: An example of circulating cell-free DNA analysis
三浦史仁
Fumihito Miura:Life Science Data Research Center, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo(東京大学大学院新領域創成科学研究科生命データサイエンスセンター)
10.18958/7915-00005-0006288-00

何ができるようになった?
従来のcfDNA解析では,短鎖の1本鎖DNAは精製やライブラリー調製の段階で失われてきた.本法により,これまで検出困難であった短鎖1本鎖cfDNAを含めた解析が可能となった.
必要な機器・試薬・テクニックは?
本稿で示す実施例では,筆者の研究室内で調製した酵素・試薬類を用いた結果を示しているが,本法と同一の原理に基づく市販試薬〔ssDNA-seq kit(タカラバイオ社)〕も利用可能である.その場合,特殊な装置や高度な技術を必要とせず,一般的な分子生物学実験環境があれば導入可能である.

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