基礎生物学研究所 ゲノムインフォマティクス トレーニングコース （GITC）
「RNA-seq 入門 - NGS の基礎から de novo 解析まで」
- 【場 所】
- 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 （愛知県岡崎市）
- 【オーガナイザー】
- 重信秀治 （基礎生物学研究所・特任准教授），内山郁夫 （基礎生物学研究所・助教）
- 【講 師】
- 佐藤昌直 （北海道大学），山口勝司，西出浩世，中村貴宣，尾納隆大 （以上，基礎生物学研究所）
- 【コース概要】
- 生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に，次世代シーケンシング （NGS） 技術を使ったトランスクリプトーム解析 （RNA-seq） をどのように実験デザインし，どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか，その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです．次世代シーケンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から，ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にする de novo RNA-seq 解析などの発展的内容までカバーします．講義とコンピュータを用いた演習を組み合わせて行います．
- 【日程と実習内容】
- 「準備編：UNIX・R・NGS の基本」2018年7月5日 （木） 〜6日 （金） UNIX 基礎，シェルスクリプト，R 入門，NGS 基本データフォーマット，NGS 基本ツール，テキスト処理
- 「実践編：RNA-seq 解析パイプライン」2018年7月26日 （木） 〜27日 （金） NGS 基本データフォーマット復習，NGS 基本ツール，統計学入門，RNA-seq 基礎，多変量解析，機能アノテーションと GO 解析
- 【受講料】
- 無料（懇親会費 4,000円程度を別途集金予定）
- 【申込方法】
- コースホームページをご覧ください．申込締め切り：5月13日 （日）
- 【募集人数】
- 16名
