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基礎生物学研究所 ゲノムインフォマティクス トレーニングコース (GITC)


「RNA-seq 入門 - NGS の基礎から de novo 解析まで」

【場 所】
自然科学研究機構 基礎生物学研究所 (愛知県岡崎市)

【オーガナイザー】
重信秀治 (基礎生物学研究所・特任准教授),内山郁夫 (基礎生物学研究所・助教)

【講 師】
佐藤昌直 (北海道大学),山口勝司,西出浩世,中村貴宣,尾納隆大 (以上,基礎生物学研究所)

【コース概要】
生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に,次世代シーケンシング (NGS) 技術を使ったトランスクリプトーム解析 (RNA-seq) をどのように実験デザインし,どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか,その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです.次世代シーケンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から,ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にする de novo RNA-seq 解析などの発展的内容までカバーします.講義とコンピュータを用いた演習を組み合わせて行います.

【日程と実習内容】
「準備編:UNIX・R・NGS の基本」2018年7月5日 (木) 〜6日 (金) UNIX 基礎,シェルスクリプト,R 入門,NGS 基本データフォーマット,NGS 基本ツール,テキスト処理

「実践編:RNA-seq 解析パイプライン」2018年7月26日 (木) 〜27日 (金) NGS 基本データフォーマット復習,NGS 基本ツール,統計学入門,RNA-seq 基礎,多変量解析,機能アノテーションと GO 解析
【受講料】
無料(懇親会費 4,000円程度を別途集金予定)

【申込方法】
コースホームページをご覧ください.申込締め切り:5月13日 (日)     
【募集人数】
16名
  • 実験医学5月号
  • 掲載